我國科研團隊建成“數(shù)字家蠶”共享分析平臺

記者從西南大學資源昆蟲高效養(yǎng)殖與利用全國重點實驗室獲悉，實驗室代方銀教授團隊取得最新科研成果——“數(shù)字家蠶”共享分析平臺，對于推動家蠶泛基因組成果在功能基因組、基因組選擇和分子設計育種等方面的研究應用具有重要意義。相關研究成果近日在國際學術期刊《核酸研究》在線發(fā)表。

在現(xiàn)代蠶學研究和育種實踐中，泛基因組序列和多組學數(shù)據(jù)已經(jīng)成為科學家手中不可或缺的基礎資源，可以縮短研究和育種的時間，顯著提高工作效率。然而，多組學大數(shù)據(jù)的整合分析和使用具有成本高、技術難度大的特點。

代方銀介紹，分析平臺不僅涵蓋家蠶基因序列信息，還整合了家蠶基因表達、調(diào)控、功能研究等數(shù)據(jù)，提供了開展比較基因組和功能基因組等方面研究的分析工具。

這是繼2022年該團隊發(fā)布家蠶超級泛基因組圖譜后，推動創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”取得的又一重大進展。分析平臺整合了家蠶泛基因組序列及多組學數(shù)據(jù)，將一個具有上千個種質資源的線下實體基因資源庫轉化為組學序列數(shù)據(jù)庫并搬上互聯(lián)網(wǎng)，實現(xiàn)種質資源基因組、遺傳變異及表型等數(shù)據(jù)的開放共享和可視化分析。

“我們將它比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘數(shù)字字典’或超級‘圖書館’，研究人員能在這里快速獲取家蠶基因組相關信息。”西南大學資源昆蟲高效養(yǎng)殖與利用全國重點實驗室博士后陸昆鵬說。（記者 周思宇）